سید علی خمینی همچنان در کنار برادرخانواده خمینی همواره به عنوان نمادی از پیوند دین و سیاست در ایران شناخته شده‌اند. در این میان، سید علی خمینی به عنوان آخرین فرزند سید احمد خمینی، نقش کلیدی در حفظ میراث امام خمینی(ره) ایفا می‌کند. او که حلقه اتصال مکاتب قم و نجف محسوب می‌شود، اخیراً با مواضع صریح خود بار دیگر توجه افکار عمومی را جلب کرده است.تبارشناسی سیاسی خاندان خمینیپس از درگذشت امام خمینی، مدیریت بیت ایشان به سید احمد خمینی سپرده شد. ویژگی‌های خاص این خاندان را می‌توان در موارد زیر خلاصه کرد:تلفیق سنت‌های حوزوی با فعالیت‌های انقلابیایفای نقش به عنوان پل ارتباطی بین نهادهای دینی و حکومتیحفظ میراث فکری و معنوی امام خمینیچالش‌های پیش روی سید حسن خمینیسید حسن خمینی به عنوان چهره علمی خانواده، همواره مورد توجه خاص حوزه‌های علمیه بوده است. اما نزدیکی او به جریان اصلاح طلب باعث ایجاد تنش با گروه‌های اصولگرا شد. این گروه‌ها با طرح‌هایی مانند:تغییر نام خانوادگی به “مصطفوی”طرح جایگزینی سید علی به جای برادرانتقادات لفظی در محافل رسمیسعی در کاهش نفوذ او داشتند.واکنش تاریخی سید علی به حواشی اخیردر مراسم اخیر قائم‌شهر، سید علی خمینی با دفاع بی‌سابقه از برادرش، موضع خود را به وضوح مشخص کرد. بخشی از اظهارات تأمل‌برانگیز او شامل این موارد بود:اشاره به برنامه‌ریزی دشمنان برای ایجاد شکاف در نظامدفاع از صلاحیت‌های علمی سید حسنتأکید بر وحدت خانواده خمینی با رهبرینقش آفرینی سید علی در معماری سیاسی جدیدبه نظر می‌رسد سید علی خمینی در حال بازتعریف نقش خود به عنوان:نظریه‌پرداز دینی-سیاسیمدیر اجرایی نشریات وابسته به بیتسفیر غیررسمی بین مراجع تقلیدعمل می‌کند. ازدواج او با دختر سید جواد شهرستانی (داماد آیت‌الله سیستانی) بر اهمیت این نقش افزوده است.نتیجه‌گیری: آینده بیت امام در ترازوی تاریخوحدت فعلی بین سید حسن و سید علی خمینی نشان می‌دهد که پروژه جریان‌های خاص برای ایجاد تفرقه در این خاندان با شکست مواجه شده است. به نظر می‌رسد حفظ میراث امام خمینی نیازمند:پرهیز از شخصیت‌پرستی افراطیتوجه به آرمان‌های اصیل انقلابتعامل سازنده با نسل جدیدباشد. سید علی خمینی با اقدامات اخیرش ثابت کرده که نه تنها دنباله‌روی برادر است، بلکه تأثیرگذاری خود را در معادلات سیاسی افزایش داده است.
